全书共分为三篇，上篇为总论部分，叙述了《伤寒论》的沿革、学术渊源及成就，重点阐述了《伤寒论》的涵义、三阴三阳六病的涵义及其传变规律与诊治方法等，还论述了阴阳六病辨证与八纲辨证、六经辨证以及卫气营血辨证的关系等。
中篇的各论部分，按分类编码的方式以三阴三阳六病及合并病为纲，以六病所表现的具体病证为目，将《伤寒论》112方所主治病证分别归类为三阴三阳六病或合并病，阐述其病因病理及证治规律，并选录《伤寒论》原文加以按语论证。
下篇为《伤寒论》的释义部分，以明赵开美复刻宋本为蓝本，以阴阳气血津液的病理变化阐释《伤寒论》398条原文所述病证之发生发展及诊治规律。